Egresado del Centro Universitario de Estudios Cinematográficos en 1982, Carlos Mendoza ha complementado su formación en el extranjero con su participación en diversas actividades académicas como: el curso de Cine directo impartido por Jean Rouch en la Universidad de Nanterre en París, Francia; el taller para la Enseñanza de documental a docentes, en la Universidad de Sao Paulo, Brasil y en apoyo a su formación como director en el Canal 6 de julio, AC, de la Fundación Ashoka, Innovators for the Public y del National Video Resources para la producción del documental Operación Galeana. Es profesor de tiempo completo titular "C" y cuenta con el nivel "D" del Programa de Primas al Desempeño del Personal Académico de Tiempo Completo. Desde 1990 imparte la materia de Guion y realización de cine documental en el Centro Universitario de Estudios Cinematográficos y ha dictado diversos cursos en instituciones académicas del país y del extranjero, como la Universidad de Guadalajara, de Aguascalientes, en el Centro Cultural de España, y en la Universidad Centroamericana de Nicaragua.